目前中德科技学院设有三个专业：机械工程、自动化、应用化学。这三个专业均是德国最为强大、居于世界领先水平的技术领域，这些领域对于国际化专业人才在国内外都有很大的需求。三个专业的德国合作院校均为德国一流高水平大学，实力雄厚，具备学士、硕士和博士完整的培养体系。

机械工程：自2001年起招生，与德国帕德博恩大学机械学院合作，是中德科技学院最早设立的专业，也是规模最大、办学经验较为丰富的专业。该专业在德国已有部分硕士毕业生，有些在德国继续带薪攻读博士，有些已经在德国就业或回国在中德合资企业就职。德国机械领域在世界上的领先地位举世闻名，由于德国是中国与欧洲的最大贸易和工业合作伙伴，德国在中国有数量众多的合资和独资企业，所以该专业毕业生的就业前景非常广阔。

机械专业德国的合作伙伴，除了帕德博恩大学之外，还包括科布伦兹应用科技大学、西鲁尔应用科技大学和伊尔梅瑙工业大学。伊尔梅瑙工业大学每年可以接受我院20名本科优秀毕业生攻读硕士。

应用化学：自2006年起招生，与德国帕德博恩大学理学院化学系合作，至今已有三批学生选拔赴德国继续专业课阶段学习，在德国的毕业生大多数将继续攻读硕士。德国在化学、化工、制药等领域一直处于世界领先地位，有很多知名的世界级大公司，学生的就业前景良好。

自动化：自2008年起招生，与德国锡根大学自然科学与技术学院电气工程系合作。德国在自动化和电气工程领域在世界上颇具盛名，毕业生就业前景良好。该专业还与德国科布伦兹应用科技大学、西鲁尔应用科技大学和伊尔梅瑙工业大学合作。伊尔梅瑙工业大学每年可以接受我院20名本科优秀毕业生攻读硕士。